課程名稱 |
生物晶片操作與資料分析 Microarray Experiment and Data Analysis |
開課學期 |
99-2 |
授課對象 |
生物資源暨農學院 生物科技研究所 |
授課教師 |
蔡孟勳 |
課號 |
Biot5006 |
課程識別碼 |
642EU0080 |
班次 |
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學分 |
3 |
全/半年 |
半年 |
必/選修 |
選修 |
上課時間 |
星期四5,6,7(12:20~15:10) |
上課地點 |
生技所415 |
備註 |
本課程以英語授課。 限學士班三年級以上 總人數上限:10人 外系人數限制:9人 |
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/992dataanalysis |
課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
Introduction of microarray and data analysis
Generation of Targets for spotted microarray
Sample plate design for spotted microarray
Printing design of microarray chip
Post-processing for microarray chip
Introduction of cell culture and RNA sample extraction
RNA purification and RNA quality check
Microarray hybridization
Microarray image scanning
Gal file preparation
Introduction of databases for microarray data analysis
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課程目標 |
This course will introduce basic concepts and techniques of “Microarray experiment and data analysis”. This course also provides the hand-on experiments for students to learn how to make microarray chips, microarray hybridization and microarray data analysis. Students will learn the hand-on skills of microarray related technology and gain a great vision on current trends of investigations in this field to lead their own research. |
課程要求 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
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評量方式 (僅供參考) |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
第1週 |
2011/02/24 |
overview |
第2週 |
2011/03/03 |
miniprep and run DNA gel electrophoresis |
第3週 |
2011/03/10 |
PCR intro, spectrophotometer intro |
第4週 |
2011/03/17 |
Plate transfer, FX intro |
第5週 |
2011/03/24 |
Printing design (OmniGrid intro) |
第8週 |
2011/04/14 |
Post-processing |
第10週 |
2011/04/28 |
Cell culture and RNA extraction |
第11週 |
2011/05/05 |
RNA purification and quality check |
第12週 |
2011/05/12 |
cDNA labeling |
第13週 |
2011/05/19 |
Hybridization |
第14週 |
2011/05/26 |
Gal file preparation and Scan image (Axon scanner intro) |
第15週 |
2011/06/02 |
Web-based Microarray Analysis and IPA intro |
第16週 |
2011/06/09 |
Real-time RT PCR |
第17週 |
2011/06/16 |
Illumina and Affymetrix system intro |
第18週 |
2011/06/23 |
Final Exam |
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